1-Major Otohemoterapi: Kişinin alınan 100 cc. kadar venöz kan özel, steril, vakumlu şişelere alınarak uygun konsantrasyonda medikal ozon gazı ile karıştırılır ve hastaya tekrar aynı damardan geri verilir. En çok uygulanan tedavi yöntem olup, kanın yıkanması ve temizlenmesi olarak bilinmektedir.
2-Minör Otohemoterapi: Hastanın damarından 3-5 cc. kadar kan alınarak ozonla karıştırılır ve kas içine Normal enjeksiyon şeklinde enjekte edilir. Romatizmal hastalıklar, alerjik hastalıklarda major uygulama ile birlikte veya yalnız başına yapılır.
3-Kas Eklem içi ve çevresine uygulama: Ozon gazının eklem içine veya çevresine uygulanmasıdır. Diz kireçlenmelerinde yapılan bir uygulamadır.
4- Rektal veya vaginal İnsufflasyon: Hastaya rektal veya vajinal yoldan medikal ozon gazı verilmesidir.
5-Transdermal ozonterapi: Ozon sauna olarak bilinen bu yöntemde bir buhar kabini içine gaz vererek, tüm ciltten emiliminin sağlanması şeklinde yapılır.
6-Torbalama metodu: Kol-bacak gibi ekstremitelerin haricen ozon gazı uygulanması amacıyla özel bir torbaya alınarak medikal ozon gazı uygulaması işlemidir.